[FRB-Cesab] Bonnes pratiques pour une recherche reproductible en écologie numérique – 2022
Gestion des versions, reproductibilité, compendium et conteneurisation
Cette formation sera dispensée en français et se déroulera du 28 novembre au 2 décembre 2022 dans les locaux du Cesab à Montpellier. Son prix est de 200 € pour la semaine – repas du midi inclus. Les frais de transport, d’hébergement et les repas du soir sont à la charge des participant(e)s.
Le GdR EcoStat propose une aide financière à celles et à ceux dont les fonds disponibles ne seraient pas suffisants. Ces bourses s’adressent en priorité aux doctorant.e.s et aux post-doctorant.e.s. Pour en bénéficier, le/la participant devra appartenir à un laboratoire membre du GdR. Le montant de l’aide financière octroyée dépendra du nombre de demandes.
Retrouvez la formation sur GitHub
Liste des intervenants (par ordre alphabétique) :
- Iago BONNICI (CNRS ISEM)
- Nicolas CASAJUS (FRB-Cesab)
- François GUILHAUMON (IRD Entropie)
- Aurélie SIBERCHICOT (UCBL LBBE)
- Accueil et présentation de la semaine
- Science ouverte et Recherche reproductible
- Research compendium et bonnes pratiques
- Gestion des versions et partage (Git, GitHub)
Mardi 29 novembre 2022
- Programmation lettrée (R Markdown)
- Optimisation du flux de travail (targets)
Mercredi 30 novembre 2022
- Gestion des versions de package (renv)
- Conteneurisation (Docker)
- Développement d’un package R
Jeudi 1 décembre 2022
- Projets en sous-groupes
Vendredi 2 décembre 2022
- Projets en sous-groupes
- Restitution des projets