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novembre 2024  I  Formation  I  Cesab  I  Autres sujets

[FRB-Cesab] La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture – 2024

Cette formation de cinq jours a pour objectif de travailler autour des différentes étapes du cycle de la donnée, de l’acquisition à l’ouverture en passant par la gestion, le stockage et la rédaction de data papers.

[FRB-Cesab] La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture – 2024

Les pré-inscriptions sont maintenant closes !

 

Le Cesab – Centre de synthèse et d’analyse sur la biodiversité – de la FRB, le Pôle National des Données de Biodiversité (PNDB) et GBIF France proposent la première édition de la formation « La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture ». Cette formation de cinq jours a pour objectif de : 1) contextualiser les enjeux autour de la compréhension, du partage et de la (ré)utilisation des données et métadonnées de biodiversité et 2) faire monter en compétences les communautés intervenant à une ou plusieurs étapes du cycle de la donnée.

 

Cette formation sera dispensée en français et se déroulera du 4 au 8 novembre 2024 dans les locaux du Cesab à Montpellier. Son prix est de 150 € pour la semaine – repas du midi inclus. Les frais de transport, d’hébergement et les repas du soir sont à la charge des participant(e)s.

 

 

Retrouvez la formation sur GitHub

 

 

 

Une bonne maîtrise du logiciel R est requise

 

 

Liste des organisateur.ice.s :

Cette liste peut être sujette à modification.

INFORMATIONS PRATIQUES

Formation : 4 – 8 Novembre 2024

 

  • Ouverture des pré-inscriptions :

6 Mai 2024

 

  • Clôture des pré-inscriptions :

9 Juin 2024, minuit (CEST)

 

  • Confirmation des inscrit.e.s :

fin Juin 2024

CESAB – FRB

5, rue de l’École de médecine

34000 Montpellier

 

Contacts

Nicolas Casajus 

FicheMail

Camille Coux

FicheMail

Pré-programme
 
Des cours magistraux suivis de travaux dirigés seront dispensés les quatre premiers jours. 
 
Introduction et tour d’horizon
  • Qu’est-ce qu’une donnée/métadonnée ?
  • Grands types de données de biodiversité
  • L’écosystème de la donnée en France et en recherche
  • Cycle de la donnée
  • Atteindre un haut degré de “FAIRitude”
  • Les défis actuels (en recherche et au-delà)
 
Acquisition des données
  • Bonnes pratiques pour une collecte de données (terrain, laboratoire, etc.)
  • Accès aux données existantes (API, web scraping, text mining, etc.)
  • Données brutes vs. données dérivées
 
Gestion des données
  • Structuration (SQL, fichiers CSV, etc.)
  • Traitement, nettoyage et homogénéisation
 
Aspects juridiques
  • Partage, licences, etc.
 
Ouverture des données
  • Plan de gestion des données
  • (Méta)données : les standards
  • Stockage et archivage
  • Diffusion et partage
  • Valorisation : le Data paper
 
Des travaux pratiques en sous-groupes seront réalisés le dernier jour.
 
CO-ORGANISATEUR