[FRB-Cesab] La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture – 2024
Cette formation de cinq jours a pour objectif de travailler autour des différentes étapes du cycle de la donnée, de l’acquisition à l’ouverture en passant par la gestion, le stockage et la rédaction de data papers.
Les pré-inscriptions sont maintenant closes !
Le Cesab – Centre de synthèse et d’analyse sur la biodiversité – de la FRB, le Pôle National des Données de Biodiversité (PNDB) et GBIF France proposent la première édition de la formation « La donnée en biodiversité : de l’acquisition à l’ouverture ». Cette formation de cinq jours a pour objectif de : 1) contextualiser les enjeux autour de la compréhension, du partage et de la (ré)utilisation des données et métadonnées de biodiversité et 2) faire monter en compétences les communautés intervenant à une ou plusieurs étapes du cycle de la donnée.
Cette formation sera dispensée en français et se déroulera du 4 au 8 novembre 2024 dans les locaux du Cesab à Montpellier. Son prix est de 150 € pour la semaine – repas du midi inclus. Les frais de transport, d’hébergement et les repas du soir sont à la charge des participant(e)s.
Retrouvez la formation sur GitHub
Une bonne maîtrise du logiciel R est requise
Liste des organisateur.ice.s :
- Nicolas CASAJUS (FRB-Cesab)
- Camille COUX (FRB-Cesab)
- Yvan LE BRAS (PNDB)
- Olivier NORVEZ (PNDB)
- Anne-Sophie ARCHAMBEAU (GBIF France)
- Sophie PAMERLON (GBIF France)
Cette liste peut être sujette à modification.
Formation : 4 – 8 Novembre 2024
- Ouverture des pré-inscriptions :
6 Mai 2024
- Clôture des pré-inscriptions :
9 Juin 2024, minuit (CEST)
- Confirmation des inscrit.e.s :
fin Juin 2024
CESAB – FRB
5, rue de l’École de médecine
34000 Montpellier
Des cours magistraux suivis de travaux dirigés seront dispensés les quatre premiers jours.
Introduction et tour d’horizon
- Qu’est-ce qu’une donnée/métadonnée ?
- Grands types de données de biodiversité
- L’écosystème de la donnée en France et en recherche
- Cycle de la donnée
- Atteindre un haut degré de “FAIRitude”
- Les défis actuels (en recherche et au-delà)
Acquisition des données
- Bonnes pratiques pour une collecte de données (terrain, laboratoire, etc.)
- Accès aux données existantes (API, web scraping, text mining, etc.)
- Données brutes vs. données dérivées
Gestion des données
- Structuration (SQL, fichiers CSV, etc.)
- Traitement, nettoyage et homogénéisation
Aspects juridiques
- Partage, licences, etc.
Ouverture des données
- Plan de gestion des données
- (Méta)données : les standards
- Stockage et archivage
- Diffusion et partage
- Valorisation : le Data paper
Des travaux pratiques en sous-groupes seront réalisés le dernier jour.